村民王某提出宅基地使用申请，乡政府审核后报县土地主管部门审批

A项，行政诉讼的对象应为做出具体行政行为的机构，本案中做出行政处罚的是水利部门，因此被告只有水利部门，乡政府不是被告，选项表述错误，排除。
B项，《行政诉讼法》第二十九条规定：“公民、法人或者其他组织同被诉行政行为有利害关系但没有提起诉讼，或者同案件处理结果有利害关系的，可以作为第三人申请参加诉讼，或者由人民法院通知参加诉讼。”土地管理部门的批准与被诉的行政行为有利害关系，因此可以作为第三人参加诉讼，选项表述正确，当选。
C项，行政诉讼的被告是水利局，法院只能对水利局处罚的合法性进行审查，如果不合法，那么对王某进行赔偿的应为水利局，土地部门只是第三人，不承担赔偿责任，选项表述错误，排除。
D项，《行政复议法》三十条规定，公民、法人或者其他组织认为行政机关的具体行政行为侵犯其已经依法取得的土地、矿藏、水流、森林、山岭、草原、荒地、滩涂、海域等自然资源的所有权或者使用权的，应当先申请行政复议；对行政复议决定不服的，可以依法向人民法院提起行政诉讼。同时《行政诉讼法》十二条第四款规定，对行政机关作出的关于确认土地、矿藏、水流、森林、山岭、草原、荒地、滩涂、海域等自然资源的所有权或者使用权的决定不服的。《行政诉讼法》是2014年新修订的,《行政复议法》是1999年实施至今的，根据两法矛盾新法优于旧法原则，应以《行政诉讼法》为准，因此王某可以不先复议。选项表述错误，排除。
故本题答案为B选项。

答案：B