下列选项中错误的是（）。A:甲就其被处行政拘留处罚起诉，由其

A项，根据《行政诉讼法》第十九条规定：“对限制人身自由的行政强制措施不服提起的诉讼，由被告所在地或者原告所在地人民法院管辖。”选项表述正确，排除。
B项，根据《行政许可法》第四十七条规定：“行政许可直接涉及申请人与他人之间重大利益关系的，行政机关在作出行政许可决定前，应当告知申请人、利害关系人享有要求听证的权利;申请人、利害关系人在被告知听证权利之日起五日内提出听证申请的，行政机关应当在二十日内组织听证。申请人、利害关系人不承担行政机关组织听证的费用。”选项表述错误，当选。
C项，根据《行政复议法》第十五条第二款规定：“对政府工作部门依法设立的派出机构依照法律、法规或者规章规定，以自己的名义作出的具体行政行为不服的，向设立该派出机构的部门或者该部门的本级地方人民政府申请行政复议。”派出所是县级公安局设立的派出机构，乙对派出所做出的行政处罚不服，可以向公安局申请行政复议，也可以向县级人民政府申请复议，选项表述正确，排除。
D项，丙工厂的做法有两点违法，一是占用行洪道，属于水利局的管辖范畴；二是违规排放，属于环保局的管辖范畴，因此环保局与水利局对该工厂分别作出处罚合法，而“一事不再罚”原则是针对同一事情，同一违法，两个部门不能分别处罚，选项情形不符合“一事不再罚”原则，选项表述正确，排除。
故本题答案为B选项。

答案：B